水草缸中的水是死水，无法像自然界中的活水不断提供二氧化碳，因此需要透过二氧化碳供应系统来补充水中二氧化碳的浓度，提供水草行光合成作用，之后产生鱼只及微生物所需的氧气。

但须注意的是，水草在有光线时吸收二氧化碳吐出氧气，睡眠时则吸收氧气吐出二氧化碳，因此二氧化碳需配合照明时间添加。