土著微生物

是在当时当地水源水域中土生土长的微生物，在水中或固着在生物包的填料上形成生物膜，是在自然状态下形成的。

传统的生物包不是利用人工培育的微生物，而是对自然生长的微生物群体加以驯化、自然选择繁殖利用。这类微生物包括细菌、真菌、藻类、原生动物和相应的分解污染物的酶体系。

土著微生物，如活性污泥，最大的问题是只降解碳系污染物有效，而对氮系污染物的作用不大。光合细菌也是水中土著菌，它能降解BOD的含碳废水，去除率98%，但对总氮的去除率仅为66.7%，比活性污泥略好，但不能解除人造水体的氮系污染物。