能够杀死细菌的光线位于紫外光谱的位置，所以称为紫外线，它的光谱波长为253.7mm，它能够杀死霉菌、藻类的孢子、细菌及病毒等有害物质。

适用于海水观赏鱼用的紫外线杀菌器都是管式的，最内层的是充满水银的低压紫外线灯管，灯管大多是石英制造，外层是一个与紫外线灯管同心的套管，它可用耐紫外线照射的材料如金属、耐辐照的迥料及石英玻璃等制成。外管两端各有一个小管做为进、出水用，内层与外管间的距离很窄只有4mm，由于紫外线穿透水的能力很弱，特别是在含有杂质较高的海水中更是如此，水沿着紫外线灯管管壁流过，可以得到100％的照射。它的杀菌效果和紫外线的功率及光波照射的时间有关，故水流不能太快的流过紫外线杀菌器。如果你的目的只是控制水族箱中藻类的生长与细菌的浓度则可以使流速较快一点，而如果是为了杀死原生寄生虫、孢子，就要使流速慢点而且要使用功率大一些的紫外线。为了保持紫外线灯管的使用效率还经常擦拭掉附着在灯上的污垢。

在使用紫外线灯时还需注意，紫外线还可以使硝酸盐还原成亚硝酸盐，如此一来便会严重的破坏过滤系统中的生物过滤平衡，为了消除这点可用臭氧配合使用，因为臭氧可以立即把亚硝酸盐氧化成硝酸盐，故我们在使用紫外线杀菌器时必须时时注意水中亚硝酸盐的变化。一个容量500L(0．5m3)的水族箱使用一只10W～15W的紫外线杀菌灯是足够了，在7天～10天内就可以完全控制水族箱的藻类生长。