如何确定疾病是由传染性病菌所引起的？通常传染病与水质恶化所产生的鱼体不适最大的差别就是最初鱼只发病的数量。

水质恶化所产生的疾病，通常都是在短时间内出现大量病鱼，也许隔一个晚上，就发现所有的鱼都夹尾，此即水质的问题。

而细菌性的传染，虽然也是由水质恶化所引起。但其致病主因仍然是由细菌侵入抵抗力弱的鱼体所造成(鱼体抵抗力弱是水质恶化导致)。初期只会有少数鱼之发病，最初的症状通常只有浮头、食欲不振等等，若饲主忽略此项症状，则给予细菌感染的机会。当细菌到达一定数量，则鱼只的抵抗力无法承受，鱼只即大量发病。
这里所指的细菌性传染病，泛指各种细菌性烂尾。

当你确定你的鱼缸中已经有会传染的菌源存在时，通常的做法整缸治疗，并辅以大量换水来减彽细菌的数量，但当细菌传染力太强或没有办法高次数换水时，提供以下的做法来控制病情。

疾病初期：(治愈率：高)
只有一只鱼发病，依照正常方式，隔离治疗，原缸下重盐，每天大量换水，持续三至五天，若停药一星期之后，没有新的鱼只发病，即可确定以控制病情。

疾病中期：(治愈率：3~5成)
若隔离第一只病鱼，数天之后原缸仍然出现病鱼，就代表疾病已在原缸中蔓延开来。此时可采用两种方式。

方法一是隔离病鱼，病鱼缸与原缸下重药，每日换水，将过滤绵全部更新，尽量减少细菌数量，持续两周，若没有新的鱼只发病，即可确定控制病情，若新的病鱼不断出现，则使用方法二。

方法二是逆向操作。将外表健康的鱼移至新缸，如果可能最好是一只一缸。健康的鱼以黄药和重盐药浴三至五天，停药后一星期没发病即是没有被传染的危险，若发病则移至病鱼缸。病鱼缸采用轻量药剂长期治疗，并辅以每天100%换水，两天喂一次，喂完之后马上换水。持续此步骤直到缸中的鱼症状消失回复活力，或是持续到鱼全部挂光为止。
若是对病鱼缸中的鱼已经放弃希望，可以考虑使用福马林或过猛酸甲等强力药物，并以短时间药浴的方式治疗一次至两次，若能侥幸存活，通常也可算治疗成功(但通常是有后遗症，而且也活不长)。

若仍然不幸倒缸，切记先将所有设备用热水烫过，重新养水，在放入新的鱼只，以免重蹈覆辙。

当鱼缸出现传染病时，治疗已是次要事项，如何防止疾病的蔓延才是重点，通常疾病蔓延会持续到鱼全部死亡为止。所以很多人养鱼常遇到养怎么死，待鱼死光之后，重新洗鱼缸布置造景，新买的鱼反而能养活，即是因为重新洗鱼缸这个动作消灭了传染病之故。