由于不少金鱼产卵后有残食鱼卵的不良习惯，因此一旦鱼巢上布满卵粒时，及时用盆将鱼巢连水舀起，放到专门的繁育池进行人工孵化，再换上新的鱼巢。如果确认大多数亲鱼已排卵完毕，可将亲鱼及时捞出放入专池中培育，让鱼巢留在原池中孵化。由于金鱼卵小且易破碎，因而不能采用脱黏法进行人工孵化，可直接将鱼巢吊挂于孵化池内，通过微流水(水流可控制在0.1米／秒左右)进行孵化。