（1）水族箱的清洁和换水：海水鱼水族箱管理中及时的加补纯水，是不可忽视的操作环节，尤其对于未加盖的水族箱，海水经过不断蒸发，而逐渐减少若不及时加水，会导致盐度过高，使鱼类渗透压急剧改变，直接威胁到鱼的生命，因此在水族箱注满水后，应及时记录水位高低，以便以后补注水时作为参考。
尽管现代水族箱因过滤系统的运作，可大大减少换水次数，但硝酸盐积累过多时，仍毒害鱼内，这时最有效的方法就是及时换水。海水水族箱的换水量和换水频率是以水族箱的大小、鱼只的数量、过滤系统有益微生物繁殖状况、饵料的种类等来考量的，要根据具体情况具体掌握。通常每20～30天需换一次水，换水量为总水量的20～25％，具体操作步骤如下：
为防止加热器爆炸、漏电等破坏器具的现象发生，换水时提前5分钟切断照明、加热、打气、过滤所有设备的电源移出加热棒等器具；利用虹吸管抽取沉淀在珊瑚砂上的脏物，和浮于水中的杂物抽出的旧水中清洗清洗沉淀于加热器上的碳酸钙，并将珊瑚放入清水中浸泡一段时间；利用水泵抽入新配制的海水，加至原水位；放回所有物件，打开电源，观察各种设备运行是否正常。
当水族箱底床过滤砂蓄积过多污物时，会阻碍水的流通性，影响水质过滤效果，此时就需要清洗整个水族箱。对于新设立的水族箱每年只需清洗一次，旧水族箱也只需要每4～6个月清洗一次即可。清洗程序要领与换水时相同，在抽水时水族箱底部要保留7厘米的海水，捞出鱼后利用底层海水清洗珊瑚砂和底部过滤板，然后抽出脏水，重新铺好过滤底层，布设好原有器具装饰品。将抽出的海水倒回水族箱，未达到水位的部分，用人工海水补足，开启气泵增加溶氧，经过半小时海水变得澄清后放回鱼只。
（2）藻类结晶盐的清除：水族箱饲养鱼类不可避免地会有藻类存在，适量的海藻有利于降低水中硝酸盐的浓度，还可以为海水鱼提供可口饵料，但是在不加以控制而导致大量滋生后，不但影响观赏效果，而且造成水质污染给鱼类的生存造成极大的威胁。为了避免这一现象，就要及时清除过多的藻类。用磁力式刮藻器每周清理一次，可确保水族箱生态系统平衡运转。刚设立的水族箱，最易滋生茶褐色的硅藻，它们多附着于缸壁表面或珊瑚上，可用海绵轻轻擦去，当，化细菌繁殖稳定后，硅藻就会逐渐减少；当硝酸盐浓度升高时，水族箱中还会出现红褐色的粘稠状海藻，虽然可以用手摘除，但这些方法并不能根除藻类，您需要找出藻类滋生的原因，判断到底是饵料投喂过多、鱼只密度太大、还是过滤器运转情况不佳，使有机毒物积累过多，根据污染源采取措施，此外水族箱中饲养几条食藻性海水鱼，如青蛙鱼等也可防止藻类滋生。在水族箱中时常会出现一种结晶状的盐巴，日久之后既会危害鱼类又有损坏器具，因此所以平时投饵时要注意用抹布擦去。
（一）投饵：刚放养的海水鱼开始可能会有几天不进食，这是由于环境变化和鱼只忙于抢夺领域而造成的，待其熟悉周围环境后，会逐渐调解过来。海水鱼的投饵原则与淡水鱼基本一致，少量多餐，亦适合于它们。每次投饵量以5～10分钟内吃完为宜，每天投喂2次。投饵应多样化，以满足各种鱼类的需求，为保持鱼体鲜亮的色彩，还可间隔投喂新鲜的活饵。在投喂海水鱼时要多注意观察：（1）观察鱼只的摄食状况，若发现有不来摄食或食欲减退的鱼只，要找出原因，及时外理。（3 ）观察摄食方式：经常观察鱼只摄食方式可了解其生活习性，久而久之就能根据水族箱不同鱼只采取不同的投饵方式。如对于岩石啃食的鱼种，可将肉类、藻类制成粘稠状，涂抹于石块上，待风干后，供鱼啄食；对于水中摄食的雀鲷等鱼种可采用多样化的投饵，选用营养丰富的丰年虫、新鲜小鱼虾、人工配制的各种干燥饵、冷冻饵，还可以投喂一些新鲜蔬菜；对于特殊摄食的鱼类来说，它们只吃珊瑚虫、青苔，很难找到适宜它们的食饵，只有从幼鱼开始培养才会逐渐适应其他替代饵料。（3）观察粪便：利用喂食后观赏鱼的时间观察粪便是否正常，能起到预防鱼病的作用。红小丑、粉蓝倒吊粪便呈白色液状，珍珠狗头、皇后神仙等粪便为碎屑状，花斑海鳗粪便呈颗粒状，根据观察及早发现鱼病，可准确地了解鱼的健康状况及早发现鱼病并加以治疗。