锦鲤鱼也是雌雄异体的水族生物，从外表上看，锦鲤似乎都是一个样子，这也让初次接触锦鲤鱼的朋友很难分辨其公母。其实，雌雄锦鲤鱼有着很明显的差别，而饲养者可以根据这些区别准确的分辨出锦鲤鱼的公母。

首先，要分辨锦鲤鱼的公母，可以分别观察幼鱼和成鱼之间的不同。简单的说，雄鱼鳃盖和胸鳍的第一条鳍条表皮细胞特别肥厚，而且需要注意的是在第一条鳍条的上面，肉眼可以看到整排许多小突起，这被称之为“追星”。

其次，在锦鲤鱼的繁殖期间，这些小点上还会有白点出现。简单的说，“追星”雄锦鲤鱼的第二性征，而雌鱼则无“追星”。

最后，雌性锦鲤鱼比雄性锦鲤鱼的腹部更肥大；肛门处雌性锦鲤鱼宽平近圆形，而雄性锦鲤鱼较小成长椭圆形；

需要注意的是，在锦鲤鱼的繁殖期间，在繁殖期雄性锦鲤鱼常尾随追逐，身体靠拢后会用头撞击雌性锦鲤鱼的身体，或吻雌鱼鱼的腹部、尾部和肛门处。饲养者也可以通过这种明显的行为区别和变化，来准确的判断出锦鲤鱼的公母。