一般来说，非洲王子鱼在同一对鱼之中，雄鱼体形比较大，雌鱼体形比较小而圆。在选购或者饲养非洲王子鱼的时候，饲养者可以根据一些特定的方法来区分非洲王子鱼雌雄。

雄性的非洲王子鱼的胸鳍和尾鳍很长，相对母鱼来说，背鳍上的黑线较粗，颜色也较深；而且同一窝鱼公鱼要比母鱼大；雄鱼的背鳍末端比较尖，雌鱼则比较圆；而雄鱼背鳍的末端会比较多点。

要分辨非洲王子鱼的雌雄，最简单的方式就是在繁殖的季节，将于肚子剖开后，如果里面有饱满的鱼子，那当然就是雌鱼了。但是这种方法对鱼儿的伤害是不言而喻的，为此要正确区分非洲王子鱼的雌雄，还是需要仔细观察鱼儿的之间的区别，然后在进行准确的区分。