1.死鱼的时间不同。
缺氧死鱼一般发生在春末秋初和夏季雷阵雨过后气压较低时，通常是在零点过后至黎明这段时间内，一般太阳出来以后就很少死鱼。而化学物中毒死鱼发生时间和季节不确定的。
2.死鱼的品种不同。
由于不同品种的耐氧程度不同，在缺氧时有些品种可能死亡，有些品种可能存活，特别是泥鳅等高耐氧的品种不容易死亡。而化学物中毒就没有选择性。
3.死鱼的个体不同。
缺氧死鱼是个体大的鱼一般先死亡，而且死亡的比例比个体小的鱼要高。而化学物中毒时个体大小的死亡先后顺序恰恰相反。
4.死鱼时的症状不同。
在水体缺氧时，鱼呈浮头状态。即鱼在水面吞咽空气，人为趋赶时会立即下沉。死亡的鱼胸鳍条一般呈冲到最前位置伸展，鳍条发白；鱼鳃鲜红有的发紫。而化学物中毒时鱼一般有冲撞、跳跃或暗浮在水面下；体表及鳃部有污染附着物。如重金属中毒时，鱼鳃分泌有大量黏液。
5.水色不同。
缺氧死鱼时，水体常散发有酸白菜味、臭味，水色常呈黑色、灰白色，与前一天相比有剧烈的水色变化。而化学物中毒时一般没什么水色变化。
