消化细菌又叫净水细菌，是一种好氧性细菌，属于异营性细菌的一类，是指能把水中有机垃圾分解转变为氨（NH3）的细菌群。氨在水中会与氢离子合成铵（NH4）。净水细菌依靠分解有机垃圾来生存繁殖。分解有机物，不是硝化细菌能完成的，是靠其它净水细菌完成的。因此，净水细菌被视为是水质自净作用的先锋部队，其重要性并不亚于硝化细菌。

硝化细菌俗称A菌，是一种好氧性细菌，属于自营性细菌的一类，包括两种完全不同代谢群：亚硝酸菌属及硝酸菌属。

亚硝酸菌属细菌以铵作为“食物”，通过把铵和氧化合所生成的化学能使其生存。铵被亚硝酸菌属细菌吸收利用后，将其氢原子氧化成水，用氧取代之，把铵变成水和氧化氮，后者化学家称为“亚硝酸”。

硝酸菌属细菌的主要“食物”来源是亚硝酸，通过把亚硝酸和氧化合所生成的化学能使其生存，把亚硝酸和氧化合转化为硝酸。

硝化细菌的特点： 过多的有机物将会抑制硝化细菌的生长和繁殖，硝化细菌是好氧菌，在缺乏氧气的环境里硝化细菌根本就无法高效率地处理氨和亚硝酸盐，甚至造成硝化细菌的生存危机。硝化细菌对光线厌恶，亚硝酸菌对近紫外线的可见光非常敏感，紫外线更使硝化细菌死亡。所以需要营造黑暗的环境让他们工作。在酸碱度方面要求在弱碱性的环境里，要求PH值6.5~8.2，亚硝酸菌ph范围7.0~8.0，最佳平均是7.8。硝酸菌范围约6.5~8.5。另外，适合温度是20~28℃。 硝化细菌的生长需要有固定的物体表面附着、掩蔽和获得其所需要的氨源及营养源。由于硝化菌的固着生活特征，必须靠水流输送它所需要的氧气、铵及营养物质等生存资源，所以必须保持水的流通。 因为有些特性，所以大家就别指望硝化细菌在肮脏的过滤棉上安家，最适宜硝化细菌居住的地方是象生化球、生化环、生化棉这样有水流通过的固定而干净的固体表面，在水流流过硝化细菌家之前最好把水里的有机垃圾提前过滤掉，不然的话，这些东东堵在里面，硝化细菌难以生长繁殖。

反硝化细菌是能将硝酸氮（NO3－-N）被还原为气态氮（N2）的细菌群，反硝化细菌是一类异养型兼性厌氧细菌。他门通过硝酸氮（NO3－-N）作为电子受体进行厌氧呼吸把氮还原，正是反硝化细菌的作用使得自然界的氮循环得以正常进行。