罗汉鱼肠炎发病一年四季都可以发生，尤其以春初、秋末发病率高。

初期，鱼体表发黑，活动减弱，进食性减退，上、下鳍开始闭鳍，黑色粪便减少，出现黄色或者是淡黄色的半透明的类似于圆球或者是长条而且是连续的粪便(也就是拖便)。

中期，每天进少量食物，对食物不感兴趣，通体发黑，常缩到缸角，不爱游动，粪便里没有黑色物质，出现浅白色粗些的粪便。鱼的肛门红肿，鱼的肚子开始变“鼓”。

晚期，鱼会出现头上尾下浮于水面的现象，肚子鼓鼓的，粪便象透明的钓鱼用的细鱼线状，而且鱼的目光呆滞，基本上是“停止游动”。