新入手的热带鱼往往会在运输过程中感染到病菌或寄生虫，初养时可能病情较轻，没有出现明显病症，但是不采用药物处理直接放入鱼缸中就很容易发病，甚至死亡。所以对新购热带鱼进行防病消毒是非常重要的。

较常用的防病消毒药物有两种，第一种是大盐(就是腌白菜的大盐)，盐比较安全、有效，并且来源方便。每10公斤水加100-300克，即配成1-3%浓度的盐水，消毒5-20分钟左右，浸浴时间长短根据水温高低而定，可杀灭大多数病菌和寄生虫。不要用食用盐，食用盐中含有碘，水中大量投放食用盐也会对鱼造成不利，应使用大盐(无碘盐)。

第二种是高锰酸钾，可以直接加入鱼缸中。用药浓度是10公斤水用0.03克高锰酸钾。0.03克重量高锰酸钾的秤重不方便。因此，先秤1克高锰酸钾充分溶解在1公斤水中，即配成千分之一浓度的药液，储存在可口可乐瓶中备用，再用吸管或针筒吸取30毫升高锰酸钾药液加入10公斤水中，用药后24小时进行换水。不过需要注意，对于小型热带鱼。高锰酸钾的毒性较大，用药后要注意观察热带鱼的活动状态，一发现有异常，立刻进行抢救，即大量换水或将热带鱼捞出。