1.顶部过滤器：一种放置在水族箱顶部的过滤装置。通过潜水马达将箱内的污水抽入已放置过滤棉、陶瓷环、生物球、活性炭等组成过滤层的过滤箱内，处理过的水再流回水族箱中，去除污水中所含杂质、有害物质，达到增氧、净化水质的效果。效率高、价格低、清理容易。

2.沉水式过滤器：直接在水族箱中使用的过滤设备。单体只能用于小型缸。

3.外置式过滤器：是一种放置在水族箱外部的过滤器，可根据不同需要放置不同滤材进行过滤。效果好，但保养不好会积粪甚至崩缸。

4.底板式过滤器： 过滤板装置放在水族箱底部。过滤板上面铺设砂、石。潜水泵带动水流经过砂石，利用砂层进行物理、生物过滤。适合各类水族箱，但遇停电将导致滤材上附著生长的好氧细菌短时间内死亡。

5.滴流式过滤器：在滤材中使用多孔性、有大表面积过滤球、陶瓷环作为主要滤材，污水经滴流板到过滤球、陶瓷环上，由过滤球、陶瓷环所培养的好氧细菌分解氮化合物等有害物质。价格昂贵，适合爱好者DIY。