针对小丑鱼这一比较受鱼友亲睐的海水鱼品种，有一系列的专项研究，其中一项关于雌雄小丑鱼的变性研究，发现小丑鱼的卵在孵化期间就被进行了“胎教”。卵被放置在父母居住的海葵根部附近，并在那里孵化。珊瑚口器和触手释放的粘液影响着发育中的卵。这种嗅觉上的胎教帮助年幼的小丑鱼选择与它们父母居住的同种类的海葵。 Arvedlund的实验是Elliot在1995年实验的延伸，当时的研究表明，即使是在顺流8米远处，小丑鱼也能够辨别自己喜欢的海葵味道。

所有的雌性小丑鱼都是由雄性转化而来的，或者说它们原本是雌雄同体的。一般共生海葵的空间内生活着一只雌性、一只雄性和许多幼鱼。雌鱼是空间的主人，她始终如一的保护着巢穴，并防止同住的雄性变身。当巢内雌性缺失时，雄性就会变身成雌性。这种转变是不可逆的，一旦它变成了雌性就再也不能成为雄性了。无论是雌性还是雄性，在幼鱼时期都在抑制性别取向，这种现象我们称为“心里阉割”。

当有雄性变身成为雌性时，幼鱼们开始争斗，角逐主导地位。胜者将变成雄性。这种性别的转换将会在一个月内发生变化。有时新加入的小丑鱼会打破这种平衡。有些小丑鱼，如双带小丑会游到500米外寻找新的海葵。有时一只强壮的小丑鱼能赶走一窝已经定居的小丑鱼，逼迫它们放弃自己的巢穴。

 


一般情况下，迁徙后它们还会选择同类的海葵。幼鱼也会迁徙到附近的海葵，以寻求在群体中地位的提高。极少情况下，幼鱼能够跳过变成雄鱼过程，直接变成雌鱼。这只能发生在雄鱼和雌鱼均离开巢穴的情况，以及幼鱼所来到的新巢穴中雄鱼和雌鱼都十分弱势的情况下。
小丑鱼雌雄的区别在于体形大小。这一点透红小丑最明显，雄性一般只有雌性的30%的个头。不过 Amphiprion clarkii和 A. frenatus, 两个性别之间的区别不大。