1使水草变红的是一种被称为花青素的物质，多数的水草叶茎内含有大量的叶绿素，所以会呈现出绿色的外貌；然而如我们常见的红色水草，红蝴蝶 红柳 红太阳 小红梅 牛顿 红菊花。。。等因叶茎内含有较多的花青素 ，而带有红色色素的花青素会将植物的绿色遮住，所以外观上便会出现我们看到的粉红色，红色，紫色棕色颜色的深浅还会受环境的影响而有不同程度的变化。
2红色水草的叶绿素被花青素的红色遮盖住一样能进行光合作用，红色水草体内也有叶绿素，他们和绿色的水草一样靠光合作用来制造能量以维持生命。只是红色水草体内含叶绿素比绿色水草的叶绿素少很多，所以红色水草进行光合作用的时需要较强的光才能产生和绿色水草相等的能量。
3还有我们可以看到绿色水草发新芽或嫩叶会带点红色，这也是花青素造成的，因为花青素在植物体内发展比叶绿素早。随着叶片长大叶绿素慢慢合成后才会完全转成翠绿，这前新芽仍需依赖母株提供成长的养份，一般情况下生长快速的水草新芽泛红的机率较高。
4有的水草水上叶也是绿色，种植在水中后欲变成了红色，这是因为进入水中后水草体内一部分的叶绿素遭受到破坏，使得红色的花青素显现出来的原故。